Tout sur les bactéries : nature, classification et types

Les bactéries sont des organismes unicellulaires microscopiques, qui n'ont pas de noyau et appartiennent au royaume Prokaryota. Bien qu'elles soient si petites que des millions peuvent tenir sur la pointe d'une épingle, leur importance pour la vie sur Terre est colossale.

Elles existent depuis plus de 3,5 milliards d'années et sont de véritables maîtresses de la survie – elles peuvent vivre aussi bien dans les glaces de l'Antarctique que dans les sources chaudes, dans le corps humain ou au fond de l'océan.

Contrairement aux cellules des plantes et des animaux, les cellules bactériennes n'ont pas de noyau entouré d'une membrane – leur matériel génétique est librement disposé dans le cytoplasme.

Malgré leur structure simple, elles possèdent une capacité d'adaptation enviable, se reproduisent rapidement et échangent des gènes entre elles, ce qui les rend particulièrement résistantes dans un environnement changeant.

Bien qu'elles soient souvent associées aux maladies, la plupart des bactéries ne sont pas nuisibles - au contraire. Elles participent à des processus vitaux comme la décomposition de la matière organique, la fixation de l'azote dans les sols, la production de vitamines dans nos intestins et même la fermentation d'aliments comme le yaourt et le fromage.

Les bactéries ne sont pas simplement des "microbes" que nous devons éviter. Elles sont des architectes invisibles de la vie. Plus nous les découvrons et les étudions, plus nous comprenons à quel point le monde autour de nous est complexe et interconnecté. Et avec l'avancement de la science, l'humanité trouve de plus en plus d'applications pour ces petits organismes au bénéfice de l'humanité.

Bien qu'à première vue toutes les bactéries semblent être simplement des « petits points sous le microscope », en réalité elles sont extrêmement des créatures diverses et complexes.

Pour être mieux comprises et étudiées, les scientifiques les classent selon différents critères liés à leur structure, leur métabolisme et leur comportement.

Les principales façons de classer les bactéries incluent :

• Forme de la cellule : Les bactéries peuvent être sphériques (cocci), en bâtonnets (bacilles), en spirale (spirilles), courbées (vibrions) et autres.

• Coloration de Gram : En fonction de la composition de leur paroi cellulaire, les bactéries se divisent en bactéries Gram-positives et Gram-négatives, ce qui est important pour le traitement des infections bactériennes.

• Leur rapport à l'oxygène : Certaines bactéries aiment l'oxygène (aérobies), d'autres ne peuvent tolérer sa présence (anaérobies), et d'autres encore s'adaptent aux deux conditions (anaérobies facultatives).

• Mode d'alimentation et métabolisme : Ici, on distingue les bactéries autotrophes (produisant leur propre nourriture par photosynthèse ou chimiosynthèse) et les bactéries hétérotrophes (obtenant des nutriments de l'environnement).

• Information génétique et proximité évolutive : Avec l'aide du séquençage de l'ADN, les relations phylogénétiques entre différentes espèces et genres bactériens sont déterminées.

La classification des bactéries n'est pas seulement une formalité scientifique. Elle aide les médecins, les écologistes et les biotechnologistes à comprendre comment fonctionnent les différentes bactéries, quelles fonctions elles remplissent et comment elles peuvent être utilisées ou contrôlées.

Pour les lecteurs ayant un intérêt plus approfondi, nous présenterons une classification plus complète et indiquerons les représentants importants de chaque groupe principal.

Divisées par taxonomie

Les bactéries sont classées en groupes taxonomiques, chacun comprenant des représentants avec des fonctions uniques et une importance biologique.

Protéobactéries (Alpha, Bêta, Gamma, Delta, Epsilon)

• Alpha – Rhizobium spp. – cette bactérie fixe l'azote dans les racines des plantes

• Bêta – Neisseria gonorrhoeae – provoque la gonorrhée

• Gamma – Escherichia coli– partie de la flore intestinale, mais aussi pathogène

• Delta – Bdellovibrio bacteriovorus – parasite d'autres bactéries

• Epsilon – Helicobacter pylori – colonise la muqueuse gastrique et est associée au développement de gastrite, ulcère

Chlamydias

• Chlamydia trachomatis – provoque la chlamydia, infection sexuellement transmissible

Spirochètes

• Treponema pallidum – provoque la syphilis

• Borrelia burgdorferi– provoque la maladie de Lyme

Cyanobactéries

• Anabaena spp. – effectue la photosynthèse et a la capacité de fixer l'azote

• Microcystis spp. – peut produire des toxines dans les plans d'eau

Firmicutes (Gram-positives)

• Clostridium botulinum– puissant neurotoxique, botulisme

• Lactobacillus spp.– probiotique, soutient la fermentation lactique

Actinobactéries

• Mycobacterium tuberculosis– provoque la tuberculose

• Streptomyces spp. – produit des antibiotiques (streptomycine, etc.)

Bactéroïdètes

• Bacteroides fragilis – maintient l'équilibre de la microflore intestinale, important pour la dégradation des polysaccharides

Planctomycètes

• Gemmata obscuriglobus – possède un espace semblable à un noyau entouré d'une membrane, inhabituel pour les bactéries

Par métabolisme

La classification des bactéries par métabolisme révèle comment les différentes espèces obtiennent de l'énergie et quelles conditions sont nécessaires pour leur croissance.

Aérobies

• Pseudomonas aeruginosa – pathogène hospitalier, résistant aux antibiotiques

• Mycobacterium tuberculosis– strictement aérobie
  

Anaérobies

• Clostridium tetani– provoque le tétanos, habite un environnement anaérobie

• Clostridium difficile– peut provoquer une diarrhée sévère, surtout après une thérapie antibiotique

Anaérobies facultatives

• Escherichia coli – peut croître avec ou sans oxygène

• Staphylococcus aureus – provoque des infections cutanées, résiste à de nombreuses conditions

Chimiolithotrophes / Phototrophes / Hétérotrophes

• Chimiolithotrophes – Nitrosomonas spp. – oxyde l'ammoniac en nitrite

• Phototrophes – Cyanobactéries (Anabaena) – utilisent la lumière pour l'énergie

• Hétérotrophes – Lactobacillus spp. – utilise des substances organiques

Par impact sur l'humain

Les bactéries interagissent avec le corps humain de différentes manières — certaines soutiennent la santé, d'autres provoquent des maladies, et d'autres encore coexistent avec nous sans avoir d'impact direct.

Bactéries bénéfiques

• Lactobacillus acidophilus– probiotique, améliore la flore intestinale et vaginale

• Bifidobacterium spp. – maintient l'équilibre dans les intestins

Bactéries pathogènes

• Streptococcus pyogenes – provoque l'angine, la scarlatine

• Yersinia pestis – provoque la peste

Commensales (ni nuisibles, ni bénéfiques)

• Staphylococcus epidermidis – partie de la microflore normale de la peau et des muqueuses chez l'humain, généralement inoffensif

• Bacteroides spp. – vit dans les intestins, en équilibre ne cause pas de tort

Les infections bactériennes sont causées par des bactéries pathogènes, qui pénètrent dans l'organisme, se multiplient et provoquent une inflammation, libèrent des toxines ou détruisent les tissus. Elles peuvent affecter presque tous les systèmes du corps.

Voici une brève classification pour vous donner une idée claire de la nature des infections bactériennes et des maladies qu'elles peuvent provoquer.

1. Par localisation (organes et systèmes)

• Système respiratoire– pneumonie (Streptococcus pneumoniae), tuberculose (Mycobacterium tuberculosis)

• Système digestif – salmonellose, dysenterie, choléra

• Système urogénital – cystite (E. coli), gonorrhée (Neisseria gonorrhoeae), chlamydia

• Peau et tissus mous – furoncles, érysipèle, gangrène gazeuse

• Système nerveux– méningite (Neisseria meningitidis, Listeria monocytogenes)

2. Par mécanisme de dommage

• Production de toxines – botulisme, tétanos, diphtérie

• Invasivité et destruction des tissus – tuberculose, syphilis

• Complications immunologiques– fièvre rhumatismale après streptocoques

3. Par mode de transmission

• Contact – sexuel, cutané (gonorrhée, syphilis)

• Alimentaire/eau – salmonelle, choléra

• Par gouttelettes– tuberculose, coqueluche

• Par vecteurs – peste (puces), maladie de Lyme (tiques)

4. Par sévérité et progression

• Aiguës – dysenterie, angine

• Chronics – tuberculose, lèpre

• Pathogènes opportunistes – Pseudomonas aeruginosa, Clostridium difficile en cas d'immunosuppression ou de thérapie antibiotique

Comprendre les types de maladies bactériennes et d'infections et leur classification est crucial pour un diagnostic rapide et un traitement approprié. Prendre des mesures préventiveset une bonne hygiène sont essentielles pour limiter la propagation de ces maladies.

Toutes les bactéries sont-elles nuisibles ?

Non, en fait, la plupart des bactéries sont bénéfiques, que ce soit pour l'humain ou pour l'environnement, d'une manière ou d'une autre.

Que sont les bactéries ?

Des organismes microscopiques qui n'ont pas de noyau, leurs organites se déplacent librement dans leur cytoplasme, séparés de l'environnement par une paroi cellulaire.

Peuvent-elles provoquer des infections graves chez les humains ?

Oui, certaines des infections les plus graves sont causées par des bactéries, et si elles ne sont pas traitées à temps, elles peuvent avoir une issue fatale.

Sources :

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK8406/

https://microbenotes.com/classification-of-bacteria/